Bos taurus Gene: RTN4 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633945.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RTN4 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | reticulon-4 isoform 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011104 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
reticulon 4 isoform 2
reticulon 4 isoform 2
reticulon 4 isoform 2
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000115310:
This gene belongs to the family of reticulon encoding genes. Reticulons are associated with the endoplasmic reticulum, and are involved in neuroendocrine secretion or in membrane trafficking in neuroendocrine cells. The product of this gene is a potent neurite outgrowth inhibitor which may also help block the regeneration of the central nervous system in higher vertebrates. Alternatively spliced transcript variants derived both from differential splicing and differential promoter usage and encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:37575270-37649696 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 48 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Axonal growth inhibition (RHOA activation) pathway
Signalling by NGF pathway
p75NTR regulates axonogenesis pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
p75NTR regulates axonogenesis pathway
Axonal growth inhibition (RHOA activation) pathway
Signalling by NGF pathway
Signal Transduction pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A7YVI6 F1N405 Q1RMR8 Q7YRW9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 359718 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.101972 Bt.105155 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001075138 NM_001113221 XM_005212571 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AY164744 BC114748 BC116111 BC123832 DAAA02030906 DAAA02030907 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI14749 AAI16112 AAI23833 AAP47319 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 359718 | ||||||||||||||||||||||