Bos taurus Gene: BT.64827 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-634263.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.64827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin-1 precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000015991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin-1 precursor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000039068:
This gene is a classical cadherin from the cadherin superfamily. The encoded protein is a calcium dependent cell-cell adhesion glycoprotein comprised of five extracellular cadherin repeats, a transmembrane region and a highly conserved cytoplasmic tail. Mutations in this gene are correlated with gastric, breast, colorectal, thyroid and ovarian cancer. Loss of function is thought to contribute to progression in cancer by increasing proliferation, invasion, and/or metastasis. The ectodomain of this protein mediates bacterial adhesion to mammalian cells and the cytoplasmic domain is required for internalization. Identified transcript variants arise from mutation at consensus splice sites. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:36221702-36243479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 140 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
Wnt pathway
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REACTOME |
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Extracellular matrix organization pathway
Cell junction organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Apoptosis pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Cell-cell junction organization pathway
Apoptosis pathway
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins pathway
Cell-cell junction organization pathway
Immune System pathway
Extracellular matrix organization pathway
Adherens junctions interactions pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Adaptive Immune System pathway
Cell junction organization pathway
Cell-Cell communication pathway
Apoptotic execution phase pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG |
Pathogenic Escherichia coli infection pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Melanoma pathway
Thyroid cancer pathway
Adherens junction pathway
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Pathways in cancer pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Thyroid cancer pathway
Melanoma pathway
Adherens junction pathway
Pathways in cancer pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
E-cadherin signaling events
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Nectin adhesion pathway
a6b1 and a6b4 Integrin signaling
Regulation of nuclear beta catenin signaling and target gene transcription
RAC1 signaling pathway
FGF signaling pathway
CDC42 signaling events
AlphaE beta7 integrin cell surface interactions
Stabilization and expansion of the E-cadherin adherens junction
E-cadherin signaling in keratinocytes
Arf6 trafficking events
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.64827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001002763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||