Bos taurus Gene: SORT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-635415.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SORT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000008849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sortilin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000134243:
This gene encodes a protein that is a multi-ligand type-1 receptor with similarity to the yeast carboxypeptidase Y sorting receptor Vps10 protein. The encoded protein, a trans-Golgi network (TGN) transmembrane protein, binds a number of unrelated ligands that participate in a wide range of cellular processes; however, it lacks the typical features of a signalling receptor. In the TGN, furin mediates the activation of the mature binding form. The encoded protein consists of a large luminal domain, a single transmembrane segment and short C-terminal cytoplasmic tail. The luminal domain contains a cysteine-rich region similar to two corresponding segments in the yeast Vps10p; the cytoplasmic tail is similar to the corresponding segment of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor and the tail also interacts with the VHS domains of GGA (Golgi-associated, gamma-adaptin homologous, ARF-interacting) proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:34150876-34214025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
Membrane Trafficking pathway
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
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KEGG |
Lysosome pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Lysosome pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
p75(NTR)-mediated signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BKZ9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 511591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.103117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002686189 XM_002703890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02007576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 511591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||