Bos taurus Gene: MED12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636055.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MED12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000021351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mediator complex subunit 12
mediator complex subunit 12
mediator complex subunit 12
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000184634:
The initiation of transcription is controlled in part by a large protein assembly known as the preinitiation complex. A component of this preinitiation complex is a 1.2 MDa protein aggregate called Mediator. This Mediator component binds with a CDK8 subcomplex which contains the protein encoded by this gene, mediator complex subunit 12 (MED12), along with MED13, CDK8 kinase, and cyclin C. The CDK8 subcomplex modulates Mediator-polymerase II interactions and thereby regulates transcription initiation and reinitation rates. The MED12 protein is essential for activating CDK8 kinase. Defects in this gene cause X-linked Opitz-Kaveggia syndrome, also known as FG syndrome, and Lujan-Fryns syndrome. [provided by RefSeq, Aug 2009] |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:84789500-84811761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 67 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Hedgehog pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
Transcriptional Regulation of Adipocyte Differentiation in 3T3-L1 Pre-adipocytes pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Mus musculus biological processes pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Developmental Biology pathway
Generic Transcription Pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of nuclear beta catenin signaling and target gene transcription
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.45486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205878 XM_005228019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||