Bos taurus Gene: TNR | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636417.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tenascin-R precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tenascin R (restrictin, janusin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000116147:
Tenascin-R (TNR) is an extracellular matix protein expressed primarily in the central nervous system. It is a member of the tenascin (TN) gene family, which includes at least 3 genes in mammals: TNC (or hexabrachion; MIM 187380), TNX (TNXB; MIM 600985), and TNR (Erickson, 1993 [PubMed 7694605]). The genes are expressed in distinct tissues at different times during embryonic development and are present in adult tissues.[supplied by OMIM, Mar 2008] This gene encodes a member of the tenascin family of extracellular matrix glycoproteins. The encoded protein is restricted to the central nervous system. The protein may play a role in neurite outgrowth, neural cell adhesion and modulation of sodium channel function. It is a constituent of perineuronal nets. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:58006950-58156083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.88153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205928 XM_005217093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||