Bos taurus Gene: RIPK1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636679.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RIPK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000006378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RIPK1 ubiquitination on Lys377 is required for tumour necrosis factor (TNF-alpha) induced NF-kappaB activation.
[Homo sapiens] RIPK1 is a death domain kinase that is one of the critical components involved in mediating DNA damage-induced, p53-independent cell death.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000137275:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 23:50420991-50446719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 119 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TNFalpha pathway
TWEAK pathway
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REACTOME |
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
TRIF-mediated programmed cell death pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Dimerization of procaspase-8 pathway
Caspase-8 activation by cleavage pathway
TNF signaling pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Apoptosis pathway
Immune System pathway
Ion channel transport pathway
Activated TLR4 signalling pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
TRP channels pathway
Regulation by c-FLIP pathway
Death Receptor Signalling pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Apoptosis pathway
Dimerization of procaspase-8 pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
Immune System pathway
TNF signaling pathway
Caspase-8 activation by cleavage pathway
Death Receptor Signalling pathway
Regulation by c-FLIP pathway
Ion channel transport pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
TRIF-mediated programmed cell death pathway
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 pathway
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
Extrinsic Pathway for Apoptosis pathway
Activated TLR4 signalling pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
MyD88-independent cascade pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
TRP channels pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
Hepatitis C pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Apoptosis pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
Hepatitis C pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
TNFR1 signaling pathway pathway
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
TNFR1 signaling pathway pathway
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PID NCI |
Ceramide signaling pathway
Caspase Cascade in Apoptosis
TNF receptor signaling pathway
TRAIL signaling pathway
Regulation of p38-alpha and p38-beta
HIV-1 Nef: Negative effector of Fas and TNF-alpha
FAS (CD95) signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.6302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001035012 XM_005223843 XM_005223844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||