Bos taurus Gene: SLC1A2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636694.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC1A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000012628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000110436:
This gene encodes a member of a family of solute transporter proteins. The membrane-bound protein is the principal transporter that clears the excitatory neurotransmitter glutamate from the extracellular space at synapses in the central nervous system. Glutamate clearance is necessary for proper synaptic activation and to prevent neuronal damage from excessive activation of glutamate receptors. Mutations in and decreased expression of this protein are associated with amyotrophic lateral sclerosis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been identified. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:66580653-66637083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.16310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_001256026 XM_002693523 XM_005194688 XM_005216398 XM_614642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||