Homo sapiens Gene: SLC1A2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-39801.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC1A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | EAAT2; GLT-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000110436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 2
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of a family of solute transporter proteins. The membrane-bound protein is the principal transporter that clears the excitatory neurotransmitter glutamate from the extracellular space at synapses in the central nervous system. Glutamate clearance is necessary for proper synaptic activation and to prevent neuronal damage from excessive activation of glutamate receptors. Mutations in and decreased expression of this protein are associated with amyotrophic lateral sclerosis. Alternatively spliced transcript variants of this gene have been identified. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:35251206-35420063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Neurotransmitter uptake and Metabolism In Glial Cells pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502338 Hs.614269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001195728 NM_001252652 NM_004171 XM_005253066 XM_005253067 XM_006718277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31459 CCDS55756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||