Bos taurus Gene: NPHP3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-639019.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NPHP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nephrocystin-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000005769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nephronophthisis 3 (adolescent)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000113971:
This gene encodes a protein containing a coiled-coil (CC) domain, a tubulin-tyrosine ligase (TTL) domain, and a tetratrico peptide repeat (TPR) domain. The encoded protein interacts with nephrocystin, it is required for normal ciliary development, and it functions in renal tubular development. Mutations in this gene are associated with nephronophthisis type 3, and also with renal-hepatic-pancreatic dysplasia, and Meckel syndrome type 7. Naturally occurring read-through transcripts exist between this gene and the downstream ACAD11 (acyl-CoA dehydrogenase family, member 11) gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:137902568-137957297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1BP93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 507522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.105674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192152 XM_005201951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:48351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02003092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 507522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||