Bos taurus Gene: LGP2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640137.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LGP2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | probable ATP-dependent RNA helicase DHX58 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LGP2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000046580 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RNA helicase LGP2
RNA helicase LGP2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] DHX58 (LGP2) helicase is related to DDX58 (RIG-I) and IFIH1 (MDA5) but lacks caspase activation and recruitment domains (CARDs), and functions as a negative regulator of innate host defence.
[Homo sapiens] DHX58 lacks the caspase recruitment domain (CARD) homology and functions as a negative regulator by interfering with the recognition of viral RNA by DDX58 (RIG-I) and IFIH1 (MDA5).
[Homo sapiens] DHX58 functions as a negative regulator of antiviral innate immunity by interfering with the recognition of viral RNA by DDX58 (RIG-I) and IFIH1 (MDA5).
[Mus musculus] Cytotoxic stress exemplified by ionizing radiation induces IFN-beta and enhances the expression of Dhx58 which in turn suppresses the interferon stimulated genes associated with cytotoxic stress by turning off the expression of IFN-beta.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000108771:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:42877797-42888179 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.27564 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001015545 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||
Transcript Frequencies | |||||||||||||||||||||||
Tag Count based mRNA-Abundances across 87 different Tissues (TPM).
Based on Data from Bovine Gene Atlas |
(Move your mouse over the image to view a more detailed version) |
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