Bos taurus Gene: PRPF6 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640419.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF6 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | Pre-mRNA-processing factor 6 | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011656 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
pre-mRNA-processing factor 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000101161:
The protein encoded by this gene appears to be involved in pre-mRNA splicing, possibly acting as a bridging factor between U5 and U4/U6 snRNPs in formation of the spliceosome. The encoded protein also can bind androgen receptor, providing a link between transcriptional activation and splicing. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:54308647-54343470 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 59 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q2KJJ0 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 534228 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.40556 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001046375 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AAFC03042419 BC105318 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAI05319 | ||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 534228 | ||||||||||||||||||||