Bos taurus Gene: JAM3 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-642813.3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | JAM3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | junctional adhesion molecule C precursor | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000003176 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
junctional adhesion molecule C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] JAM3 is a key regulator of polarized neutrophil transendothelial migration in vivo. (Demonstrated in murine model)
[Mus musculus] Jam3 is a key regulator of polarized neutrophil transendothelial migration in vivo.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000166086:
Tight junctions represent one mode of cell-to-cell adhesion in epithelial or endothelial cell sheets, forming continuous seals around cells and serving as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space. The protein encoded by this immunoglobulin superfamily gene member is localized in the tight junctions between high endothelial cells. Unlike other proteins in this family, the this protein is unable to adhere to leukocyte cell lines and only forms weak homotypic interactions. The encoded protein is a member of the junctional adhesion molecule protein family and acts as a receptor for another member of this family. A mutation in an intron of this gene is associated with hemorrhagic destruction of the brain, subependymal calcification, and congenital cataracts. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 29:33546279-33577319 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Hemostasis pathway
Hemostasis pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Tight junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta2 integrin cell surface interactions
amb2 Integrin signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A7YW22 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 513412 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.59609 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001105364 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC134427 DAAA02063283 DAAA02063284 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI34428 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 513412 | ||||||||||||||||||||||||||||