Mus musculus Gene: Jam3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145910.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Jam3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | junction adhesion molecule 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110002N23Rik; JAM-3; JAM-C; Jcam3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
junction adhesion molecule 3
junction adhesion molecule 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Jam3 is a key regulator of polarized neutrophil transendothelial migration in vivo.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] JAM3 is a key regulator of polarized neutrophil transendothelial migration in vivo. (Demonstrated in murine model)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000166086:
Tight junctions represent one mode of cell-to-cell adhesion in epithelial or endothelial cell sheets, forming continuous seals around cells and serving as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space. The protein encoded by this immunoglobulin superfamily gene member is localized in the tight junctions between high endothelial cells. Unlike other proteins in this family, the this protein is unable to adhere to leukocyte cell lines and only forms weak homotypic interactions. The encoded protein is a member of the junctional adhesion molecule protein family and acts as a receptor for another member of this family. A mutation in an intron of this gene is associated with hemorrhagic destruction of the brain, subependymal calcification, and congenital cataracts. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:27097385-27155421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hemostasis pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
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KEGG |
Tight junction pathway
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta2 integrin cell surface interactions
amb2 Integrin signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.28770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_023277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||