Bos taurus Gene: MLH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-644253.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MLH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA mismatch repair protein Mlh1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000016758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Uncharacterized protein
Uncharacterized protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000076242:
This gene was identified as a locus frequently mutated in hereditary nonpolyposis colon cancer (HNPCC). It is a human homolog of the E. coli DNA mismatch repair gene mutL, consistent with the characteristic alterations in microsatellite sequences (RER+phenotype) found in HNPCC. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Additional transcript variants have been described, but their full-length natures have not been determined.[provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:10492112-10585992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 130 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Meiotic recombination pathway
Cell Cycle pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
Meiosis pathway
DNA Repair pathway
Meiotic Recombination pathway
Mus musculus biological processes pathway
Cell Cycle pathway
DNA Repair pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Meiosis pathway
Meiotic recombination pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Endometrial cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
Endometrial cancer pathway
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Direct p53 effectors
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.30133 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001075994 XM_005222490 XM_005222492 XM_005222493 XM_005222494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||