Bos taurus Gene: TREX1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-646133.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TREX1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | three prime repair exonuclease 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000008406 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
three prime repair exonuclease 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000213689:
This gene encodes a nuclear protein with 3' exonuclease activity. The encoded protein may play a role in DNA repair and serve as a proofreading function for DNA polymerase. Mutations in this gene result in Aicardi-Goutieres syndrome, chilblain lupus, Cree encephalitis, and other diseases of the immune system. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2012] This gene encodes a nuclear protein with 3\' exonuclease activity. The encoded protein may play a role in DNA repair and serve as a proofreading function for DNA polymerase. Mutations in this gene result in Aicardi-Goutieres syndrome, chilblain lupus, Cree encephalitis, and other diseases of the immune system. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:51969881-51971755 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Regulation by TREX1 pathway
STING mediated induction of host immune responses pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Immune System pathway
Regulation by TREX1 pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5E9M7 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 282099 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.7472 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174475 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BT020893 DAAA02054432 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAX08910 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 282099 | ||||||||||||||||||||||||