Homo sapiens Gene: CDH23 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77620.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDH23 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin-related 23 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000107736 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
cadherin-related 23
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the cadherin superfamily, whose genes encode calcium dependent cell-cell adhesion glycoproteins. The encoded protein is thought to be involved in stereocilia organization and hair bundle formation. The gene is located in a region containing the human deafness loci DFNB12 and USH1D. Usher syndrome 1D and nonsyndromic autosomal recessive deafness DFNB12 are caused by allelic mutations of this cadherin-like gene. Alternative splice variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jan 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:71396934-71815947 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.656032 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001171930 NM_001171931 NM_001171933 NM_001171934 NM_022124 NM_052836 XM_003403623 XM_005275689 XM_006717941 XM_006717942 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53540 CCDS73146 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05699 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||