Mus musculus Gene: Cdh23 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-154608.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdh23 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin 23 (otocadherin) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4930542A03Rik; ahl; ahl1; bob; bus; mdfw; nmf112; nmf181; nmf252; sals; USH1D; v | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000012819 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin 23 (otocadherin)
cadherin 23 (otocadherin)
cadherin 23 (otocadherin)
cadherin 23 (otocadherin)
cadherin 23 (otocadherin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107736:
This gene is a member of the cadherin superfamily, whose genes encode calcium dependent cell-cell adhesion glycoproteins. The encoded protein is thought to be involved in stereocilia organization and hair bundle formation. The gene is located in a region containing the human deafness loci DFNB12 and USH1D. Usher syndrome 1D and nonsyndromic autosomal recessive deafness DFNB12 are caused by allelic mutations of this cadherin-like gene. Alternative splice variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jan 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:60302748-60696490 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B4 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.440327 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252635 NM_023370 XM_006513594 XM_006513595 XM_006513596 XM_006513597 XM_006513598 XM_006513599 XM_006513600 XM_006513601 XM_006513603 XM_006513604 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56704 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||