Homo sapiens Gene: XPA | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-78000.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XPA | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | xeroderma pigmentosum, complementation group A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000136936 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
xeroderma pigmentosum, complementation group A
xeroderma pigmentosum, complementation group A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a zinc finger protein involved in DNA excision repair. The encoded protein is part of the NER (nucleotide excision repair) complext which is responsible for repair of UV radiation-induced photoproducts and DNA adducts induced by chemical carcinogens. Mutations in this gene are associated with xeroderma pigmentosum complementation group A. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:97674909-97697357 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Dual incision reaction in GG-NER pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.654364 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000380 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6729 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02045 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||