Homo sapiens Gene: RQCD1 | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-81033.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RQCD1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe) | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CNOT9; CT129; RCD-1; RCD1 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000144580 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
RCD1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe)
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the highly conserved RCD1 protein family. The encoded protein is a transcriptional cofactor and a core protein of the CCR4-NOT complex. It may be involved in signal transduction as well as retinoic acid-regulated cell differentiation and development. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:218568580-218597080 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q35 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Deadenylation of mRNA pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA degradation pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92600 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4DJE1 D5MQE1 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9125 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.148767 Hs.699959 Hs.703862 Hs.732405 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001271634 NM_001271635 NM_005444 XM_005246942 XM_005246943 XM_006712832 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10445 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 612054 | ||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33379 CCDS63123 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08828 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB500892 AC012510 AK293281 AK296037 BC007102 BC137455 BC137456 CH471063 D87957 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH07102 AAI37456 AAI37457 BAA13508 BAG58803 BAH11481 BAJ07307 EAW70625 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9125 | ||||||||||||||||||||||||||