Version 5.4
| Homo sapiens Gene: C1GALT1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-8487.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | C1GALT1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000106392 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1
core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1
core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1
core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1
core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
The protein encoded by this gene generates the common core 1 O-glycan structure, Gal-beta-1-3GalNAc-R, by the transfer of Gal from UDP-Gal to GalNAc-alpha-1-R. Core 1 is a precursor for many extended mucin-type O-glycans on cell surface and secreted glycoproteins. Studies in mice suggest that this gene plays a key role in thrombopoiesis and kidney homeostasis.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 7:7156934-7248651 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p22.1 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
O-linked glycosylation of mucins pathway
Post-translational protein modification pathway
O-linked glycosylation pathway
Metabolism of proteins pathway
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| KEGG |
Mucin type O-Glycan biosynthesis pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.239666 Hs.605894 Hs.735517 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_020156 XM_005249812 XM_005249813 XM_006715759 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS5355 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 16631 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||