Homo sapiens Gene: SNRNP40 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-95411.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRNP40 | ||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5) | ||||||||||||||||||
Synonyms | 40K; HPRP8BP; PRP8BP; PRPF8BP; SPF38; WDR57 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000060688 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5)
small nuclear ribonucleoprotein 40kDa (U5)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a component of the U5 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) particle. The U5 snRNP is part of the spliceosome, a multiprotein complex that catalyzes the removal of introns from pre-messenger RNAs. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:31259568-31296782 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p35.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 49 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.33962 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004814 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS340 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08481 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||