Homo sapiens Gene: B2M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9902.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | B2M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | beta-2-microglobulin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000166710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
beta-2-microglobulin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a serum protein found in association with the major histocompatibility complex (MHC) class I heavy chain on the surface of nearly all nucleated cells. The protein has a predominantly beta-pleated sheet structure that can form amyloid fibrils in some pathological conditions. A mutation in this gene has been shown to result in hypercatabolic hypoproteinemia.[provided by RefSeq, Sep 2009] This gene encodes a serum protein found in association with the major histocompatibility complex (MHC) class I heavy chain on the surface of nearly all nucleated cells. The protein has a predominantly beta-pleated sheet structure that can form amyloid fibrils in some pathological conditions. The encoded antimicrobial protein displays antibacterial activity in amniotic fluid. A mutation in this gene has been shown to result in hypercatabolic hypoproteinemia.[provided by RefSeq, Aug 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:44711477-44718877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 188 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC pathway
Endosomal/Vacuolar pathway pathway
ER-Phagosome pathway pathway
DAP12 signaling pathway
DAP12 interactions pathway
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell pathway
Interferon gamma signaling pathway
Nef mediated downregulation of MHC class I complex cell surface expression pathway
Amyloids pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Interferon Signaling pathway
Nef-mediates down modulation of cell surface receptors by recruiting them to clathrin adapters pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
HIV Infection pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
The role of Nef in HIV-1 replication and disease pathogenesis pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
Disease pathway
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KEGG |
Antigen processing and presentation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
Downstream signaling in naïve CD8+ T cells
IL12-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.623704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004048 XM_005254549 XM_006725182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||