Homo sapiens Gene: POU2F1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104534.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POU2F1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | POU class 2 homeobox 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | oct-1B; OCT1; OTF1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000143190 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
POU class 2 homeobox 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The OCT1 transcription factor was among the first identified members of the POU transcription factor family (summarized by Sturm et al., 1993 [PubMed 8314572]). Members of this family contain the POU domain, a 160-amino acid region necessary for DNA binding to the octameric sequence ATGCAAAT.[supplied by OMIM, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:167220829-167427345 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q24.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 97 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcium signaling in the CD4+ TCR pathway
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
ATF-2 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
Regulation of Androgen receptor activity
FOXA1 transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.283402 Hs.599861 Hs.617075 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198783 NM_001198786 NM_002697 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1259 CCDS55655 CCDS55656 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01250 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||