Homo sapiens Gene: IRF6 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-106452.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LPS; OFC6; PIT; PPS; PPS1; VWS; VWS1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000117595 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 6
interferon regulatory factor 6
interferon regulatory factor 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IRF6 belongs to a family of transcription factors that share a highly conserved helix-turn-helix DNA-binding domain and a less conserved protein-binding domain.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the interferon regulatory transcription factor (IRF) family. Family members share a highly-conserved N-terminal helix-turn-helix DNA-binding domain and a less conserved C-terminal protein-binding domain. The encoded protein may be a transcriptional activator. Mutations in this gene can cause van der Woude syndrome and popliteal pterygium syndrome. Mutations in this gene are also associated with non-syndromic orofacial cleft type 6. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:209785623-209806175 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q32.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 18 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591415 Hs.609106 Hs.735356 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206696 NM_006147 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1492 CCDS55681 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06227 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||