Homo sapiens Gene: TCF12 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-13567.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TCF12 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor 12 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHb20; CRS3; HEB; HsT17266; HTF4 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000140262 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
transcription factor 12
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the basic helix-loop-helix (bHLH) E-protein family that recognizes the consensus binding site (E-box) CANNTG. This encoded protein is expressed in many tissues, among them skeletal muscle, thymus, B- and T-cells, and may participate in regulating lineage-specific gene expression through the formation of heterodimers with other bHLH E-proteins. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:56918623-57299281 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 41 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
ID pathway
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REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.511504 Hs.595728 Hs.608843 Hs.659471 Hs.682266 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003205 NM_207036 NM_207037 NM_207038 NM_207040 XM_006720658 XM_006720659 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10159 CCDS10160 CCDS42042 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02725 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||