Homo sapiens Gene: SNW1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14100.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SNW domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Bx42; NCOA-62; Prp45; PRPF45; SKIIP; SKIP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SNW domain containing 1
SNW domain containing 1
SNW domain containing 1
SNW domain containing 1
SNW domain containing 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene, a member of the SNW gene family, encodes a coactivator that enhances transcription from some Pol II promoters. This coactivator can bind to the ligand-binding domain of the vitamin D receptor and to retinoid receptors to enhance vitamin D-, retinoic acid-, estrogen-, and glucocorticoid-mediated gene expression. It can also function as a splicing factor by interacting with poly(A)-binding protein 2 to directly control the expression of muscle-specific genes at the transcriptional level. Finally, the protein may be involved in oncogenesis since it interacts with a region of SKI oncoproteins that is required for transforming activity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:77717599-77761207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q24.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 148 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME |
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Pre-NOTCH Transcription and Translation pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Notch-HLH transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Pre-NOTCH Expression and Processing pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Notch signaling pathway pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3V4X8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.445498 Hs.717778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_012245 XM_005267414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC008372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||