Homo sapiens Gene: SNRPD1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1426.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPD1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HsT2456; Sm-D1; SMD1; SNRPD | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000167088 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide 16kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a small nuclear ribonucleoprotein that belongs to the SNRNP core protein family. The protein may act as a charged protein scaffold to promote SNRNP assembly or strengthen SNRNP-SNRNP interactions through nonspecific electrostatic contacts with RNA. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a small nuclear ribonucleoprotein that belongs to the SNRNP core protein family. The protein may act as a charged protein scaffold to promote SNRNP assembly or strengthen SNRNP-SNRNP interactions through nonspecific electrostatic contacts with RNA. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:21612267-21630456 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 136 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.464734 Hs.597957 Hs.723796 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006938 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32801 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03040 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||