Mus musculus Gene: Snrpd2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-149635.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snrpd2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1810009A06Rik; SMD2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000040824 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000125743:
The protein encoded by this gene belongs to the small nuclear ribonucleoprotein core protein family. It is required for pre-mRNA splicing and small nuclear ribonucleoprotein biogenesis. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:19149722-19152735 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 78 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
snRNP Assembly pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P62317 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q14AF6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 545531 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.357757 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_026943 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20892 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98345 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Snrpd2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK007389 AK045968 AK088105 BC043014 BC051208 BC116858 BC116860 CH466639 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH43014 AAH51208 AAI16859 AAI16861 BAB25006 BAC32551 BAC40147 EDL23112 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 107686 545531 | ||||||||||||||||||||||