Mus musculus Gene: Ikzf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-150234.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ikzf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | IKAROS family zinc finger 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5832432G11Rik; hlk-1; Ikaros; LyF-1; mKIAA4227; Zfpn1a1; Znfn1a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
IKAROS family zinc finger 1
IKAROS family zinc finger 1
IKAROS family zinc finger 1
IKAROS family zinc finger 1
IKAROS family zinc finger 1
IKAROS family zinc finger 1
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to a family of transcription factors that are characterized by a set of four DNA-binding zinc fingers at the N-terminus and two C-terminal zinc fingers involved in protein dimerization. It is regulated by both epigenetic and transcription factors. This protein is a transcriptional regulator of hematopoietic cell development and homeostasis. In addition, it is required to confer temporal competence to retinal progenitor cells during embryogenesis, demonstrating an essential function in nervous system development. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Sep 2014] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:11685003-11772926 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 32 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5GGW4 Q5SWT7 Q5SWU0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.103545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009578 XM_006514685 NM_001025597 XM_006514669 XM_006514670 XM_006514671 XM_006514673 XM_006514674 XM_006514675 XM_006514676 XM_006514680 XM_006514682 XM_006514683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24437 CCDS24436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1342540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ikzf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AL596450 AY536270 BC138789 CH466574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI38790 AAT09852 EDL40640 EDL40643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||