Homo sapiens Gene: SF3A2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15767.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3A2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | splicing factor 3a, subunit 2, 66kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PRP11; PRPF11; SAP62; SF3a66 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000104897 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
splicing factor 3a, subunit 2, 66kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes subunit 2 of the splicing factor 3a protein complex. The splicing factor 3a heterotrimer includes subunits 1, 2 and 3 and is necessary for the in vitro conversion of 15S U2 snRNP into an active 17S particle that performs pre-mRNA splicing. Subunit 2 interacts with subunit 1 through its amino-terminus while the single zinc finger domain of subunit 2 plays a role in its binding to the 15S U2 snRNP. Subunit 2 may also function independently of its RNA splicing function as a microtubule-binding protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:2236504-2248679 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 152 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007165 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12084 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02877 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||