Mus musculus Gene: Atm | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-165511.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ataxia telangiectasia mutated homolog (human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI256621; C030026E19Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ataxia telangiectasia mutated homolog (human)
ataxia telangiectasia mutated homolog (human)
ataxia telangiectasia mutated homolog (human)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Unrepaired DNA lesions induce type I interferons via the Tmem173 pathway, resulting in enhanced anti-viral and anti-bacterial responses in Atm (-/-) mice.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000149311:
The protein encoded by this gene belongs to the PI3/PI4-kinase family. This protein is an important cell cycle checkpoint kinase that phosphorylates; thus, it functions as a regulator of a wide variety of downstream proteins, including tumor suppressor proteins p53 and BRCA1, checkpoint kinase CHK2, checkpoint proteins RAD17 and RAD9, and DNA repair protein NBS1. This protein and the closely related kinase ATR are thought to be master controllers of cell cycle checkpoint signaling pathways that are required for cell response to DNA damage and for genome stability. Mutations in this gene are associated with ataxia telangiectasia, an autosomal recessive disorder. [provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:53439149-53536740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A5.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 19 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 120 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Meiotic Recombination pathway
ATM mediated phosphorylation of repair proteins pathway
p53-Independent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Mus musculus biological processes pathway
Recruitment of repair and signaling proteins to double-strand breaks pathway
Cellular responses to stress pathway
p53-Independent DNA Damage Response pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Double-Strand Break Repair pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
G2/M DNA damage checkpoint pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cell Cycle pathway
Stabilization of p53 pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
DNA Repair pathway
Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A pathway
Cellular Senescence pathway
Fanconi Anemia pathway pathway
G2/M Checkpoints pathway
Cellular response to heat stress pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Regulation of HSF1-mediated heat shock response pathway
Meiosis pathway
Meiotic recombination pathway
Homologous Recombination Repair pathway
ATM mediated response to DNA double-strand break pathway
Regulation of the Fanconi anemia pathway pathway
Homologous recombination repair of replication-independent double-strand breaks pathway
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KEGG |
p53 signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Apoptosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G2/M DNA damage checkpoint pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Stabilization of p53 pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A pathway
p53-Independent DNA Damage Response pathway
Regulation of the Fanconi anemia pathway pathway
Fanconi Anemia pathway pathway
Recruitment of repair and signaling proteins to double-strand breaks pathway
ATM mediated phosphorylation of repair proteins pathway
ATM mediated response to DNA double-strand break pathway
Meiotic recombination pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cellular responses to stress pathway
p53-Independent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Regulation of HSF1-mediated heat shock response pathway
Homologous Recombination Repair pathway
G2/M Checkpoints pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Cell Cycle pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Cellular Senescence pathway
Cellular response to heat stress pathway
Homologous recombination repair of replication-independent double-strand breaks pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Meiosis pathway
DNA Repair pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
Apoptosis pathway
p53 signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Fanconi anemia pathway
p53 pathway
E2F transcription factor network
Canonical NF-kappaB pathway
BARD1 signaling events
ATM pathway
Validated transcriptional targets of deltaNp63 isoforms
Regulation of Telomerase
p38 MAPK signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z0Q2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.5088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007499 XM_006509956 XM_006509957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Atm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC079869 AC156640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 11920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||