Mus musculus Gene: Ripk3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-165974.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ripk3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | receptor-interacting serine-threonine kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610528K09Rik; AW107945; Rip3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
receptor-interacting serine-threonine kinase 3
receptor-interacting serine-threonine kinase 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ripk3 forms a complex with Ticam1 upon Toll-like receptors (TLR) 3 and 4 activation resulting in Ripk3-dependent but TNF-independent necrosis in macrophages.
Ripk3 interacts with Zbp1 to mediate virus-induced necrosis.
Ripk3 has a novel function in NF-kB activation, dendritic cell biology, innate inflammatory-cytokine expression, and injury-induced tissue repair.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] RIPK3 forms a complex with TICAM1 upon Toll-like receptors (TLR) 3 and 4 activation resulting in RIPK3-dependent but TNF-independent necrosis in macrophages. (Demonstrated in mouse)
[Homo sapiens] RIPK3 interacts with ZBP1 to mediate virus-induced necrosis. (Demonstrated in mice)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000129465:
The product of this gene is a member of the receptor-interacting protein (RIP) family of serine/threonine protein kinases, and contains a C-terminal domain unique from other RIP family members. The encoded protein is predominantly localized to the cytoplasm, and can undergo nucleocytoplasmic shuttling dependent on novel nuclear localization and export signals. It is a component of the tumor necrosis factor (TNF) receptor-I signaling complex, and can induce apoptosis and weakly activate the NF-kappaB transcription factor. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:55784996-55788857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 103 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 pathway
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
TRIF-mediated programmed cell death pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Immune System pathway
Ion channel transport pathway
Activated TLR4 signalling pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
TRP channels pathway
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KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
EPO signaling pathway pathway
VEGF signaling pathway pathway
TNFR1 signaling pathway pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.46612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164107 NM_001164108 NM_019955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27131 CCDS49499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||