Mus musculus Gene: Trim13 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-171622.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim13 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif-containing 13 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3110001L12Rik; CAR; LEU5; Rfp2; RNF77 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000035235 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif-containing 13
tripartite motif-containing 13
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TRIM13 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000204977:
This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This gene is located on chromosome 13 within the minimal deletion region for B-cell chronic lymphocytic leukemia. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:61598226-61605946 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.23959 Mm.405992 Mm.490061 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164220 NM_023233 XM_006519392 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27186 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||