Mus musculus Gene: Phf8 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179199.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Phf8 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 8 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041229 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
PHD finger protein 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000172943:
The protein encoded by this gene is a histone lysine demethylase that preferentially acts on histones in the monomethyl or dimethyl states. The encoded protein requires Fe(2+) ion, 2-oxoglutarate, and oxygen for its catalytic activity. Defects in this gene are a cause of mental retardation syndromic X-linked Siderius type (MRXSSD). Four transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:151520672-151633859 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell Cycle, Mitotic pathway
Chromatin organization pathway
HDMs demethylate histones pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Condensation of Prophase Chromosomes pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Mitotic Prophase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.17156 Mm.474866 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001113354 NM_177201 XM_006528875 XM_006528876 XM_006528877 XM_006528880 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30470 CCDS53223 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||