Mus musculus Gene: Rnf220 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179719.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf220 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 220 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4732477A13; 4931406I20Rik; 5730503K05Rik; AV302541 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028677 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ring finger protein 220
ring finger protein 220
ring finger protein 220
ring finger protein 220
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000187147:
|
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:117271463-117497052 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6PDX6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2APN9 Q9D4L6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 66743 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.318331 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025739 XM_006503287 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18534 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1913993 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rnf220 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK016436 AK041785 AK172415 AL645740 AL844169 BC034875 BC056359 BC058415 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH34875 AAH56359 AAH58415 BAB30235 BAE20604 BAE42996 CAM20837 CAM20839 CAM23616 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 66743 | ||||||||||||||||||||||