Mus musculus Gene: Agps | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-181523.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Agps | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | alkylglycerone phosphate synthase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000042410 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
alkylglycerone phosphate synthase
alkylglycerone phosphate synthase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000018510:
This gene is a member of the FAD-binding oxidoreductase/transferase type 4 family. It encodes a protein that catalyzes the second step of ether lipid biosynthesis in which acyl-dihydroxyacetonephosphate (DHAP) is converted to alkyl-DHAP by the addition of a long chain alcohol and the removal of a long-chain acid anion. The protein is localized to the inner aspect of the peroxisomal membrane and requires FAD as a cofactor. Mutations in this gene have been associated with rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 3 and Zellweger syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:75832177-75931350 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Plasmalogen biosynthesis pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
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KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Plasmalogen biosynthesis pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2AL49 Q8BKC4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 228061 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.31227 Mm.448862 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_172666 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16151 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2443065 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Agps | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK053686 AL773533 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAC35474 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 228061 | ||||||||||||||||||||||