Mus musculus Gene: Brdt | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-186768.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Brdt | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | bromodomain, testis-specific | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029279 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
bromodomain, testis-specific
bromodomain, testis-specific
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the BET protein family. BET proteins have two N-terminal bromodomains and one C-terminal extraterminal domain (ET domain). BET proteins regulate chromatin reorganization via binding to acetylated histones. This gene is thought to play a role in the transcriptional regulation of spermatogenesis. Although referred to as testis-specific bromodomain (Brdt) protein, RT-PCR indicates that this gene is expressed in both mouse oocytes and testes. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:107331159-107387058 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q91Y44 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BNZ8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 114642 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.182836 Mm.475506 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_054054 XM_006534728 XM_006534729 XM_006534730 NM_001079873 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19500 CCDS39197 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1891374 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Brdt | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB208640 AC126598 AF358660 AK078663 CH466529 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAK50736 BAC37352 BAD91553 EDL20168 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 114642 | ||||||||||||||||||||||