Mus musculus Gene: Cx3cr1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204952.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cx3cr1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-X3-C) receptor 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000052336 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-X3-C) receptor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000168329:
Fractalkine is a transmembrane protein and chemokine involved in the adhesion and migration of leukocytes. The protein encoded by this gene is a receptor for fractalkine. The encoded protein also is a coreceptor for HIV-1, and some variations in this gene lead to increased susceptibility to HIV-1 infection and rapid progression to AIDS. Four transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:119901616-120068283 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | F4 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR ligand binding pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Z0D9 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q543X3 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13051 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.44065 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009987 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40806 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1333815 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cx3cr1 | ||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF074912 AF102269 AK044557 AK137388 AK140010 BC012653 CH466587 DQ360291 DQ360292 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC72408 AAD08665 AAH12653 ABC95973 ABC95975 BAC31979 BAE23340 BAE24210 EDL09189 | ||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13051 | ||||||||||||||||||||||||||