Homo sapiens Gene: CX3CR1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-26647.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CX3CR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CCRL1; CMKBRL1; CMKDR1; GPR13; GPRV28; V28; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
chemokine (C-X3-C motif) receptor 1
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Protein Structure |
![]() |
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Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Fractalkine is a transmembrane protein and chemokine involved in the adhesion and migration of leukocytes. The protein encoded by this gene is a receptor for fractalkine. The encoded protein also is a coreceptor for HIV-1, and some variations in this gene lead to increased susceptibility to HIV-1 infection and rapid progression to AIDS. Four transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:39263494-39281735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p22.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Method
Confidence
Comments
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Signal Transduction pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID BIOCARTA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P49238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JLM2 C9JN40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.78913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001171171 NM_001171172 NM_001171174 NM_001337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43069 CCDS54571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC092053 AK312373 AY016370 BC028078 CH471055 DA413545 EF064744 EU006531 U20350 U28934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA87032 AAA91783 AAH28078 AAK08627 ABK41927 ABS29268 BAG35291 EAW64576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||