Homo sapiens Gene: RCAN1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2768.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RCAN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | regulator of calcineurin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ADAPT78; CSP1; DSC1; DSCR1; MCIP1; RCN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000159200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
regulator of calcineurin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
RCAN1 (DSCR1) short isoform positively modulates IL-1R-mediated signalling pathways by regulating TOLLIP/IRAK1/TRAF6 complex formation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene interacts with calcineurin A and inhibits calcineurin-dependent signaling pathways, possibly affecting central nervous system development. This gene is located in the minimal candidate region for the Down syndrome phenotype, and is overexpressed in the brain of Down syndrome fetuses. Chronic overexpression of this gene may lead to neurofibrillary tangles such as those associated with Alzheimer disease. Three transcript variants encoding three different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene interacts with calcineurin A and inhibits calcineurin-dependent signaling pathways, possibly affecting central nervous system development. This gene is located in the minimal candidate region for the Down syndrome phenotype, and is overexpressed in the brain of Down syndrome fetuses. Chronic overexpression of this gene may lead to neurofibrillary tangles such as those associated with Alzheimer disease. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:34513142-34615142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Calcium signaling in the CD4+ TCR pathway
Notch-mediated HES/HEY network
Role of Calcineurin-dependent NFAT signaling in lymphocytes
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.282326 Hs.737849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001285389 NM_001285391 NM_001285392 NM_001285393 NM_004414 NM_203417 NM_203418 XM_005260930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13637 CCDS33551 CCDS42921 CCDS74788 CCDS74790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||