Homo sapiens Gene: PRICKLE1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-27853.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRICKLE1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | prickle homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000139174 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
prickle homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear receptor that may be a negative regulator of the Wnt/beta-catenin signaling pathway. The encoded protein localizes to the nuclear membrane and has been implicated in the nuclear trafficking of the transcription repressors REST/NRSF and REST4. Mutations in this gene have been linked to progressive myoclonus epilepsy. Alternate splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene is found on chromosome 3. [provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:42456754-42590355 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PCP/CE pathway pathway
beta-catenin independent WNT signaling pathway
Signaling by Wnt pathway
Signal Transduction pathway
Asymmetric localization of PCP proteins pathway
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KEGG |
Wnt signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96MT3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R0W7 F8VUG8 F8W1J1 F8W1Q8 Q687H3 Q687H4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 144165 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.720221 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001144881 NM_001144882 NM_001144883 NM_153026 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17019 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608500 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8742 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16341 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC079600 AC079601 AF399844 AF543759 AF543760 AK056189 AK056499 BC114939 BC114940 CH471111 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI14940 AAI14941 AAQ03035 AAQ11824 AAQ11825 BAB71116 BAB71198 EAW57854 EAW57855 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 144165 | ||||||||||||||||||||||