Homo sapiens Gene: HPCAL1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28496.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HPCAL1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | hippocalcin-like 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BDR1; HLP2; VILIP-3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000115756 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
hippocalcin-like 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of neuron-specific calcium-binding proteins family found in the retina and brain. It is highly similar to human hippocalcin protein and nearly identical to the rat and mouse hippocalcin like-1 proteins. It may be involved in the calcium-dependent regulation of rhodopsin phosphorylation and may be of relevance for neuronal signalling in the central nervous system. Several alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:10302889-10427617 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p25.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3241 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.467696 Hs.580427 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001258357 NM_001258358 NM_001258359 NM_002149 NM_134421 XM_005246160 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5145 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600207 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1671 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02564 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3241 | ||||||||||||||||||||||