Homo sapiens Gene: CSPG5 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-31813.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CSPG5 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C) | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NGC | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000114646 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C)
chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C)
chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C)
chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a proteoglycan that may function as a neural growth and differentiation factor. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:47562239-47580792 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Dermatan sulfate biosynthesis pathway
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis pathway
CS/DS degradation pathway
Chondroitin sulfate biosynthesis pathway
Mucopolysaccharidoses pathway
Myoclonic epilepsy of Lafora pathway
Defective B4GALT7 causes EDS, progeroid type pathway
Defective CHST6 causes MCDC1 pathway
MPS VI - Maroteaux-Lamy syndrome pathway
Defective PAPSS2 causes SEMD-PA pathway
Metabolism of carbohydrates pathway
MPS IIID - Sanfilippo syndrome D pathway
Defective SLC26A2 causes chondrodysplasias pathway
MPS IX - Natowicz syndrome pathway
Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS pathway
Defective CHST14 causes EDS, musculocontractural type pathway
Heparan sulfate/heparin (HS-GAG) metabolism pathway
MPS IV - Morquio syndrome B pathway
Defective B3GAT3 causes JDSSDHD pathway
Defective CHST3 causes SEDCJD pathway
MPS IV - Morquio syndrome A pathway
Defective EXT2 causes exostoses 2 pathway
Diseases associated with glycosaminoglycan metabolism pathway
MPS II - Hunter syndrome pathway
Defective B4GALT1 causes B4GALT1-CDG (CDG-2d) pathway
Glycosaminoglycan metabolism pathway
Diseases of glycosylation pathway
Chondroitin sulfate/dermatan sulfate metabolism pathway
MPS VII - Sly syndrome pathway
Defective CHSY1 causes TPBS pathway
Metabolism pathway
MPS I - Hurler syndrome pathway
MPS IIIA - Sanfilippo syndrome A pathway
MPS IIIC - Sanfilippo syndrome C pathway
Disease pathway
Glycogen storage diseases pathway
MPS IIIB - Sanfilippo syndrome B pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95196 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10675 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.45127 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206942 NM_001206945 NM_001206943 NM_001206944 NM_006574 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2467 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606775 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56252 CCDS2757 CCDS56253 CCDS74930 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC099778 AC112512 AF059274 AF461087 AF461088 AF461089 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC69612 AAQ04774 AAQ04775 AAQ04776 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10675 | ||||||||||||||||||||||||