Homo sapiens Gene: SREBF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33208.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SREBF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sterol regulatory element binding transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHd1; SREBP-1c; SREBP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000072310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sterol regulatory element binding transcription factor 1
sterol regulatory element binding transcription factor 1
sterol regulatory element binding transcription factor 1
sterol regulatory element binding transcription factor 1
sterol regulatory element binding transcription factor 1
sterol regulatory element binding transcription factor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
SREBF1 deficient mice are resistant to endotoxic shock and systemic inflammatory response syndrome induced by cecal ligation and puncture. SREBF1 is not only a necessary transcription factor for lipogenesis genes in macrophages, but is also responsible for the expression of NLRP1A, which is a core inflammasome component. (Demonstrated in murine model)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Srebf1 deficient mice are resistant to endotoxic shock and systemic inflammatory response syndrome induced by cecal ligation and puncture. Srebf1 is not only necessary for transcription of lipogenesis genes in macrophages, but is also responsible for the expression of Nlrp1a, which is a core inflammasome component.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a transcription factor that binds to the sterol regulatory element-1 (SRE1), which is a decamer flanking the low density lipoprotein receptor gene and some genes involved in sterol biosynthesis. The protein is synthesized as a precursor that is attached to the nuclear membrane and endoplasmic reticulum. Following cleavage, the mature protein translocates to the nucleus and activates transcription by binding to the SRE1. Sterols inhibit the cleavage of the precursor, and the mature nuclear form is rapidly catabolized, thereby reducing transcription. The protein is a member of the basic helix-loop-helix-leucine zipper (bHLH-Zip) transcription factor family. This gene is located within the Smith-Magenis syndrome region on chromosome 17. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:17810399-17837002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 109 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
ID pathway
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REACTOME |
RORA activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
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KEGG |
Insulin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
RXR and RAR heterodimerization with other nuclear receptor
mTOR signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.592123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001005291 NM_004176 XM_005256772 XM_006721570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11189 CCDS32583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||