Homo sapiens Gene: SEMA3F | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-35942.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA3F | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SEMA-IV; SEMA4; SEMAK | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000001617 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The semaphorins are a family of proteins that are involved in signaling. All the family members have a secretion signal, a 500-amino acid sema domain, and 16 conserved cysteine residues (Kolodkin et al., 1993 [PubMed 8269517]). Sequence comparisons have grouped the secreted semaphorins into 3 general classes, all of which also have an immunoglobulin domain. The semaphorin III family, consisting of human semaphorin III (SEMA3A; MIM 603961), chicken collapsin, and mouse semaphorins A, D, and E, all have a basic domain at the C terminus. Chicken collapsin contributes to path finding by axons during development by inhibiting extension of growth cones (Luo et al., 1993 [PubMed 8402908]) through an interaction with a collapsin response mediator protein of relative molecular mass 62K (CRMP62) (Goshima et al., 1995 [PubMed 7637782]), a putative homolog of an axonal guidance associated UNC33 gene product (MIM 601168). SEMA3F is a secreted member of the semaphorin III family.[supplied by OMIM, Mar 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:50155045-50189075 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Axon guidance pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H7C4A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6405 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.32981 Hs.734969 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004186 XM_005265381 XM_005265382 XM_006713290 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10728 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601124 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2811 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03079 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC000063 AC104450 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6405 | ||||||||||||||||||||||||||||||