Homo sapiens Gene: HLA-DOB | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-403007.3 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | HLA-DOB | ||||||||||||||||||
Gene Name | major histocompatibility complex, class II, DO beta | ||||||||||||||||||
Synonyms | DOB | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000241106 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
major histocompatibility complex, class II, DO beta
major histocompatibility complex, class II, DO beta
major histocompatibility complex, class II, DO beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
HLA-DOB belongs to the HLA class II beta chain paralogues. This class II molecule is a heterodimer consisting of an alpha (DOA) and a beta chain (DOB), both anchored in the membrane. It is located in intracellular vesicles. DO suppresses peptide loading of MHC class II molecules by inhibiting HLA-DM. Class II molecules are expressed in antigen presenting cells (APC: B lymphocytes, dendritic cells, macrophages). The beta chain is approximately 26-28 kDa and its gene contains 6 exons. Exon one encodes the leader peptide, exons 2 and 3 encode the two extracellular domains, exon 4 encodes the transmembrane domain and exon 5 encodes the cytoplasmic tail. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:32812763-32817048 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p21.32 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
MHC class II antigen presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Antigen processing and presentation pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Graft-versus-host disease pathway
Asthma pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Leishmaniasis pathway
Staphylococcus aureus infection pathway
Toxoplasmosis pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.1802 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002120 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4754 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08368 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||