Homo sapiens Gene: PTPRR | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47763.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPRR | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | protein tyrosine phosphatase, receptor type, R | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | EC-PTP; PCPTP1; PTP-SL; PTPBR7; PTPRQ | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000153233 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
protein tyrosine phosphatase, receptor type, R
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and a single intracellular catalytic domain, and thus represents a receptor-type PTP. Silencing of this gene has been associated with colorectal cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. This gene shares a symbol (PTPRQ) with another gene, protein tyrosine phosphatase, receptor type, Q (GeneID 374462), which is also located on chromosome 12. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:70638073-70920843 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q15 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
FSH pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
MAPK signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.506076 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001207015 NM_001207016 NM_002849 NM_130846 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44945 CCDS55847 CCDS55848 CCDS8998 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04169 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||