Version 5.4
| Homo sapiens Gene: VPS29 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-57168.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | VPS29 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000111237 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene belongs to a group of vacuolar protein sorting (VPS) genes that, when functionally impaired, disrupt the efficient delivery of vacuolar hydrolases. The protein encoded by this gene is a component of a large multimeric complex, termed the retromer complex, which is involved in retrograde transport of proteins from endosomes to the trans-Golgi network. This VPS protein may be involved in the formation of the inner shell of the retromer coat for retrograde vesicles leaving the prevacuolar compartment. Alternative splice variants encoding different isoforms, and usage of multiple polyadenylation sites have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 12:110491097-110502117 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q24.11 | ||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 57 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Disease pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.600114 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001282150 NM_016226 NM_057180 XM_006719459 XM_006719462 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS41832 CCDS53832 CCDS73525 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 09499 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||