Homo sapiens Gene: ATR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-59521.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ATR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ataxia telangiectasia and Rad3 related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FCTCS; FRP1; MEC1; SCKL; SCKL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000175054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ataxia telangiectasia and Rad3 related
ataxia telangiectasia and Rad3 related
ataxia telangiectasia and Rad3 related
ataxia telangiectasia and Rad3 related
ataxia telangiectasia and Rad3 related
ataxia telangiectasia and Rad3 related
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs the PI3/PI4-kinase family, and is most closely related to ATM, a protein kinase encoded by the gene mutated in ataxia telangiectasia. This protein and ATM share similarity with Schizosaccharomyces pombe rad3, a cell cycle checkpoint gene required for cell cycle arrest and DNA damage repair in response to DNA damage. This kinase has been shown to phosphorylate checkpoint kinase CHK1, checkpoint proteins RAD17, and RAD9, as well as tumor suppressor protein BRCA1. Mutations of this gene are associated with Seckel syndrome. An alternatively spliced transcript variant of this gene has been reported, however, its full length nature is not known. Transcript variants utilizing alternative polyA sites exist. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:142449235-142578826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 125 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of ATR in response to replication stress pathway
G2/M DNA damage checkpoint pathway
Meiotic synapsis pathway
Regulation of the Fanconi anemia pathway pathway
Fanconi Anemia pathway pathway
Cellular responses to stress pathway
Regulation of HSF1-mediated heat shock response pathway
G2/M Checkpoints pathway
Cell Cycle pathway
Cellular response to heat stress pathway
Meiosis pathway
DNA Repair pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
p53 signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Fanconi anemia pathway
p53 pathway
Signaling events mediated by TCPTP
Circadian rhythm pathway
BARD1 signaling events
ATR signaling pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H0Y8Y6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.271791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC109992 AC134509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||