Mus musculus Gene: Scnm1-ps | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-605626.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scnm1-ps | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sodium channel modifier 1, pseudogene | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3110001I17Rik; Scnm1-ps | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000092607 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sodium channel modifier 1
sodium channel modifier 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Mutations in the voltage-gated sodium channel gene Scn8a lead to neurological problems in mice. For one particular mutation, Scn8amedJ, mice live to adulthood but have tremors and muscle weakness, among other problems, in all strains except those derived from C57BL6 mice. In these strains, the product of the Scnm1 gene (229 aa) partially overcomes the effects of the Scn8amedJ mutation. However, in C57BL6-derived mice, a one nt change in the penultimate exon creates a premature stop codon, truncating the Scnm1 protein at 186 aa. This truncated protein lacks the ability to overcome the effects of the Scn8amedJ mutation, and these mice suffer paralysis and juvenile death. [provided by RefSeq, Jul 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:95129536-95134011 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F2.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001163573 NM_027013 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50986 CCDS50987 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||